Разберёмся по порядку:
1. В случае нахождения с заряженным оружием в отношении вас может быть возбуждено производство по факту нарушения Правил охоты ст.53. При осуществлении охоты запрещается: 53.1.- нахождение в охотничьих угодьях в (на) механических транспортных средствах,... с расчехленным или заряженным или имеющим патроны (снаряды) в магазине охотничьим огнестрельным (пневматическим) оружием,
С вытекающими отсюда последствиями - Охота без разрешения, охота в запрещенных местах и т.п.
2. Если вы ссылаетесь на то, что оружие используется для самообороны, то нарушаете ст. 24 Закона об оружии, в которой сказано -
Граждане Российской Федерации могут применять имеющееся у них на законных основаниях оружие для защиты жизни, здоровья и собственности в состоянии необходимой обороны или крайней необходимости...
Запрещается обнажение оружия в случае, если отсутствуют основания для его применения, предусмотренные частью первой настоящей статьи (за исключением случаев, предусмотренных законодательством Российской Федерации).
За пределами машины, если вы будете находиться с собранным и заряженным оружием вас могут привлечь за нарушение п.6 ст. 6 Закона об оружии - На территории Российской Федерации запрещаются: ...ношение гражданами в целях самообороны огнестрельного длинноствольного оружия и холодного оружия, за исключением случаев перевозки или транспортирования указанного оружия;
Отсюда следует, что хранение оружия в транспорте должно осуществляться разряженным и в чехле. Заряжаться оружие в целях самообороны должно непосредственно перед применением.